Beaucoup de petits cours d’eau sont sous pression. Les rares petits ruisseaux encore relativement préservés sont menacés d'être à leur tour enterrés, canalisés et/ou fortement pollués.
Les rives sont souvent bâties et leur végétation coupée, de sorte qu'elles ne sont plus en mesure de jouer leur rôle de tampon. Beaucoup de ruisseaux se trouvent donc dans l'incapacité de remplir leurs fonctions écologiques et d'offrir un habitat adéquat à la faune piscicole. Leur rôle pour les poissons serait pourtant particulièrement important puisqu'ils offrent un milieu propice aussi bien à un séjour permanent qu'à la reproduction et au développement des juvéniles.
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